SMD (Spartan Molecular Database) その一

マニュアルによればＳｐａｒｔａｎ　04ではCambridge Structure Database (CSD)が使えることになっていた。
フーフー言ってマニュアル読んで挑戦してみても、全く見えない。ファイルパスを見てみるとＣドライブにのprpgram filesというところに、ＣＣＤＣというディレクトリがあってデータのやり取りをするらしい。早速自分のＣドライブを見てみたがそんなファイルは無い。単にインストールされていないだけかと思い、インストールＣＤの中身を見てみたが、やっぱりそんなファイルが出来そうにも無い。
　困って、Ｗａｖｅｆｕｎｃｔｉｏｎの内田さんに電話して聞くことにした。判ったことは大阪大学蛋白研究所に申し込まなければいないとのこと。Ｗｅｂでは15万7千円プラスアルファ。無理でした。
せっかくマニュアルとにらめっこしたのに、がっかりであった。ちなみにＷｅｂサイトは
http://www.protein.osaka-u.ac.jp/csd/csd.html

内田さんからＳｐａｒｔａｎ　Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｄａｔａｂａｓｅはそっくり使えるとのこと。確かに、こちらはマニュアルどおりに使える。ただ、free valenceの指定の仕方はわからなかった。どうもＳｅａｒｃｈから一度Ｄａｔａｂａｓｅｓを読んで指定したい原子、結合をクリックする。これはいくらマニュアル読んでも判らなかった。

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