パソコンでの実験はお金がかからないし、結構面白い。
主観だらけの、客観性も信頼性も全く無いページです。
お気に入りの無料ソフト
rasmol PDBブラウザ
ViewerLite PDBブラウザ
ChemiCal 化学用のデスクトップ計算器(マクロを公開しました。)
ChemScketch 分子ドローソフト
パソコンを使った分子計算
パソコン分子モデリングは簡単なようで、難しい。難しいようで、結構簡単。
パソコンも理論も数学も(ついでに化学も)インチキな私のパソコン体験記です。
- 分子計算の私感 独り言です。
Windows版Spartanを使って思うこと。 (以下、Spartanを使っていて感じたことです。)
SpartanではWindows版でも完全マルチタスク??
Spartanは大きな分子が苦手??
Chem3DのデータをSpartan04で扱うときの工夫。
ローカルミニマム付近の構造を初期配座に用いたら、最適化収束しなかった時の工夫。
構造の最適化が途中で終わってしまい、「failed]の表示が出たときの対処。
MMFFは精度が高い??
MMFFはファンデルワールス力を過剰に評価する??
MINDO法について。
Spartan04でNMRの化学シフトが予想できる??
Spartanの配座解析
SystematicとMonte-Carlo
SMD (Spartan Molecular Database)その1
SMD (Spartan Molecular Database)その2
ペプチドを計算するに適切な方法?
非対称な二級アミンの配座解析
計算方法の選択?? - テウリレンを例として